Situé au siège de l'UNOPS à Copenhague, Danemark, l'EMO apporte un appui aux centres d’opérations dans la région en assurant la supervision financière des projets et en procurant à ceux-ci les biens, services et ressources humaines nécessaires.

L'EMO coordonne les activités des centres d’opérations et de projets de l'UNOPS :
Ceux-ci facilitent a leur tour l'exécution des opérations à travers le monde.
En plus, l'EMO gère deux unités responsables des programmes dans des secteurs clés tels que les eaux internationales et les programmes régionaux dans les États arabes.
Unité des Eaux internationales
L'Unité des Eaux internationales gère un portefeuille de projets régionaux et globaux, visant à prévenir et préserver la dégradation de l'environnement des eaux internationales causée par la pollution, la surpêche, la sécheresse, les modifications de l'habitat et les espèces envahissantes.
Travaillant pour le compte d'organisations partenaires telles que le Programme des Nations Unies pour le développement (PNUD), le Programme des Nations Unies pour l'environnement (PNUE) et la Banque mondiale, l'Unité cherche à créer une coopération internationale dans des régions aussi diverses que celles des fleuves Danube et Niger ; des mers Caspienne, Noire et Jaune, du lac Tchad et de la nappe phréatique du bassin du Limpopo.
L'Unité supervise également des projets de portée mondiale intéressant des partenaires tels que le Fonds pour l'environnement mondial (FEM) et le Réseau des échanges et d'apprentissage sur les eaux internationales (IW: LEARN).
Programmes régionaux pour les pays arabes et l'Unité de Chypre
Les Programmes régionaux pour les pays arabes s'appuie sur l'Unité de Chypre pour mettre en œuvre des projets au nom des bureaux régionaux du PNUD, tant pour les États arabes que pour l'Europe. L'Unité assure la supervision technique et financière de projets, l'obtention de ressources financières et humaines, et le lancement d'appels d’offres pour les Programmes régionaux pour les pays arabes établis dans les villes clés de la région : Amman, Beyrouth, Le Caire, Tunis et Nicosie. Les programmes interviennent sur un ensemble de secteurs tels que le patrimoine culturel, l'égalité du genre, la gouvernance, l'enseignement supérieur, le VIH-sida, le développement humain, les technologies de l’information et de la communication et la gestion des connaissances.