Le siège de l’UNOPS se situe à Copenhague, ainsi que le Bureau pour l’Europe et le Moyen-Orient.
L’UNOPS opère selon une «approche de pratique», ce qui permet la coordination du processus décisionnel parmi les quatre pratiques de gestion:
Le Directeur exécutif, le Directeur exécutif adjoint et les directeurs de chaque pratique dirigent depuis siège un réseau de personnel travaillant dans les bureaux sur le terrain. Ces pratiques représentent également les différents services que l’UNOPS propose à ses partenaires.
L’approche de pratique permet également d’articuler les domaines clés, appelés aussi pratiques de soutien à la mise en œuvre, qui dépendent de la demande et qui seront reconsidérés chaque année:
Chacune des directions de pratique sont localisées au siège de l’UNOPS, tout comme le personnel de l’UNOPS travaillant dans le cadre de ces pratiques, tel que l’unité juridique, l’unité de l’audit interne, l’unité de l’informatique et celle des Communications.