Qu'elle soit bilatérale ou multilatérale, l'assistance aux gouvernements des pays en développement tend donc de plus en plus vers un support direct sur un plan budgétaire.

Simultanément, l'acheminement des fonds de la communauté internationale passe de plus en plus par la mise en commun des ressources.  Celles-ci prennent très souvent la forme de Fonds d'affectation spéciale multi-donateurs répondant à des problématiques transfrontalières - telles que les initiatives prises dans les domaines de l'environnement et de la santé - ou à des besoins spécifiques d'un pays en particulier. Ces changements ont stimulé de la part des donateurs, et des bénéficiaires eux-mêmes, un besoin accru de mécanismes de responsabilisation. 

Depuis sa création, l'UNOPS propose une assistance dans la gestion de fonds en offrant des services d'administration de prêts et de certification. Au fil des ans, ces services ont été étendus à un ensemble d'activités de soutien (voir ci-dessous). 

A la demande de ses partenaires et clients, l'UNOPS peut assumer entièrement la responsabilité fiduciaire pour la gestion des fonds, émanant sous forme de prêts ou subventions de donateurs uniques ou multiples, et dont l'exécution est prévue dans un ou plusieurs pays. Pour répondre à des besoins de supervision et de certification de prêts et subventions, ainsi que du développement des capacités, l'UNOPS adapte ses services selon les nécessités spécifiques de ses partenaires et clients, tout en se pliant aux exigences propres aux pays impliqués.  

Les tâches spécifiques, accomplies ensemble ou séparément, selon les souhaits des partenaires et clients incluent :

• La gestion de fonds d'affectation spéciale, les services financiers et les comptes rendus d'activités
• La révision et l'approbation (ou recommandations pour approbation) de candidatures
• L'évaluation des capacités nationales, incluant les institutions gouvernementales et les ONGs, pour exécuter les activités relatives aux prêts et subventions 
• L'évaluation des capacités et mandats des organisations internationales et ONGs pour mener à bien les activités
• Le développement des capacités des institutions nationales, notamment des ONGs, dans les domaines de gestion financière et de comptabilité, de compte rendu d'activités, de gestion de projet, de passation de marchés, de gestion des ressources humaines, de gestion des connaissances, de suivi et d'évaluation
• Des conseils prodigués aux candidats sur la façon d'interpréter et de répondre aux exigences propres aux prêts et subventions au cours de toutes les étapes du projet, de la phase de conception au compte rendu final
• Le suivi et compte rendu des activités du projet
• La justification relative à l'utilisation des fonds
• Les recommandations pour des décaissements supplémentaires
• L'audit indépendant des cahiers financiers et comptables
• L'audit de conformité aux accords et procédures en vigueur