L’UNOPS est entré en partenariat avec le Haut Commissariat des Nations Unies pour les Refugiés dans plusieurs pays, en soutenant l’Agence onusienne dans la bonne exécution de ses projets.
Bureau Regional pour l'Asie et le Pacifique
Le Bureau Régional de l’UNOPS en Asie et Pacifique a été impliqué dans la Gestion des Ressources Humaines pour l’UNHCR depuis 2005. L’UNOPS a soutenu le recrutement de personnel local et a exécuté les tâches administratives pour la désignation de personnel hautement qualifié dans le cadre du Programme de Réinstallation en Malaisie. En Thaïlande, l’UNOPS a fourni les ressources humaines pour la gestion des conditions requises pour la Réinstallation dans le cadre du Programme de solutions durables d’UNHCR à la frontière Thaï-Myanmar, une de plus grandes opérations de la région.
Au Népal, plus de 100,000 refugiés Bhoutanais se sont installés dans de camps selon des lignes ethniques et de caste et sont sous le mandate de l’UNHCR. En collaboration avec le Gouvernement du Népal, l’UNHCR coordonne les efforts à déployer en la matière avec d’autres pays de réinstallation. A partir de 2008, le rôle de l’UNOPS a été de fournir le soutien consultatif pour la gestion des contrats et des ressources humaines dans le cadre de ce programme de réinstallation multi-annuel. Les chiffres montrent depuis 2008 que 170 personnels de projet ont été recrutés pour UNHCR Malaisie et 77 personnels de projet ont été recrutés pour UNHCR Thaïlande.
République démocratique du Congo
Afin d’obtenir plus d’informations sur les besoins des déplacés internes (IDPs) en République Démocratique du Congo, un projet inter-agences de profilage financé par le Haut Commissariat des Nations Unies pour les Refugiés (UNHCR) et exécuté en étroite collaboration avec le PAM a été lancé dans les camps de déplacés dans la Province du Nord Kivu. Depuis février 2009 le projet est exécuté par l’UNOPS.
Le Ministère de l’Agriculture, ainsi que des ONG locales et internationales, collaborent à l’exercice en cours.
L’activité de profilage permet d’apprendre davantage sur l’histoire des déplacements de personnes, leurs zones d’origine, la composition familiale et les vulnérabilités. Ceci permet à l’UNHCR et à ses partenaires de mieux planifier et fournir de l’assistance humanitaire.
L’exercice de profilage devrait continuer jusqu’en 2010 et bâtir sur ses réussites au Nord Kivu en étendant les activités au Sud Kivu et à la Province Orientale, où les attaques armées sur les civiles ont provoqué des déplacements massifs de population.
Irak
En travaillant en partenariat avec le Ministère du Déplacement et de la Migration du Gouvernement d’Iraq et avec le financement du Fonds d'Affectation Spéciale pour l'Iraq du Groupe des Nations Unies pour le Développement, l’UNOPS a soutenu une initiative de l’UNHCR qui visait le renforcement des capacités des autorités nationales, régionales et locales de l’Iraq en matière de soutien aux déplacés. Le projet a aidé à développer un avant-projet de politique nationale sur les déplacés à travers des enquêtes sur les intentions des IDPs et des consultations avec les communautés. Le projet a également permis aux communautés frappées par les déplacements de résoudre pacifiquement les conflits en développant des programmes d’apprentissage sur la résolution des disputes à travers le pays. Il a été achevé en Décembre 2008.
Jordanie
L’UNHCR exécute en Jordanie plusieurs types de projets qui demandent du personnel spécialisé et de soutien pour répondre aux besoins des réfugiés. En Juin 2009, l’UNOPS a été choisi comme partenaire d’exécution par l’UNHCR pour fournir les services de gestion des ressources humaines et recruter le personnel en ICA (Individual Contractor Agreement) en Jordanie. Cet accord se termine en Décembre 2009 et des préparatifs sont en cours pour le prolonger jusqu’à 2010.
Kenya
Le Centre d’Opérations de l’UNOPS au Kenya administre le personnel ICA local pour le Bureau UNHCR Kenya depuis 2005, selon un accord sur les ressources humaines, pour un total de 71 personnels administrés en 2009. Le personnel de l’UNHCR fournit de l’assistance aux refugiés de la région dans les zones kenyanes de Kakuma et Dadaab.
Libéria
En partenariat avec le Gouvernement de Libéria, UNHCR a sélectionné l’UNOPS pour exécuter la composante infrastructure du projet “Etat de droit” pour le pays. En 2008, 4 complexes de police ont été construits pour le compte de la Police Nationale du Libéria pour servir les départements ruraux de Grand Bassa, Maryland, Grand Gedeh et Lofa. Chaque complexe a inclus un bureau administratif, des baraquements et l’installation d’électricité, d’égouts et d’adductions pour la fourniture d’eau.
Deux bâtiments de Tribunaux, équipés de puits d’eau et de pompes à main, ont été construits dans les départements de Margibi et Grand Gedeh. Les bureaux de l’Office d’Immigration et Naturalisation et de la Commission de Rapatriement, Réinstallation et Réintégration ont été 
achevés à Harper, dans le département de Maryland près de la frontière avec la Côte D’Ivoire et à Bo-Waterside, dans le département de Grand Cape près de la frontière avec la Sierra Leone. Ces infrastructures ont renforcé l’Etat de droit à travers le pays et permis le retour graduel et la réintégration des Libériens.
Sri Lanka
Afin de fournir des abris pour des dizaines de déplacés et en partenariat avec le Gouvernement du Sri Lanka, l’UNOPS a soutenu la construction d’abris temporaires à partir de «kits d’abri d’émergence » pré-assemblés, dans la région septentrionale de Vavuniya. L’équipe Eau et Assainissement de l’UNOPS a fourni les toilettes et le drainage pour le camp d’assistance. Le projet a été financé par l’UNHCR et par le CERF (Central Emergency Response Fund). L’UNOPS est le plus grand fournisseur d’abris d’urgence au Sri Lanka et le principal partenaire d’UNHCR dans l’installation des abris dans le pays.
Syrie
L’UNHCR exécute en Syrie plusieurs types de projets qui demandent du personnel spécialisé et de soutien pour répondre aux besoins des réfugiés. Le Centre d’opérations en Irak de l’UNOPS apporte son aide en fournissant à l’UNHCR des services de gestion des ressources humaines et se charge de recruter le personnel en ICA (Individual Contractor Agreement) dans le cadre de ces projets.
Zambie
Conduite par le Gouvernement de la Zambie et soutenue par l’UNHCR et plusieurs bailleurs, « L’Initiative Zambie » a été un programme multisectoriel ayant pour but d’atténuer les effets du déficit alimentaire, de la déficience des infrastructures et de l’accès limité aux services publics et aux opportunités économiques. L’objectif a été de trouver des solutions durables pour environs 500.000 refugiés de la région. L’Initiative a mis en œuvre des activités de développement local en faisant travailler ensemble les refugiés et les communautés locales afin de faciliter leur intégration. L’UNOPS a fourni à l’UNHCR le soutien technique, administratif et logistique pour toute la durée du projet. Le Chargé de Programme pour l’Initiative a également été recruté par l’UNOPS, qui a joué un rôle clé de consultant pour la structure managériale.